Eu tive diversos problemas em rede com o Windows 2003 R2 ao tentar copiar grandes arquivos para outras maquinas.
Para resolver o problema foi necessário fazer 2 passos, que devem ser feitos e testados individualmente, pois em 4 casos funcionou mas tive um servidor específico que não deu certo e era a placa de rede com defeito.

Este recurso faz o pacote de rede ser escalável, ou seja, o Windows dinamicamente muda o tamanho do pacote conforme o tipo e a constancia do tráfego. Parece muito bom, porem nem todos os SOs e dispositivos de rede tem suporte a este recurso, o que causa o problema da queda de conexão.

Muitas vezes apenas desabilitando o CHIMNEY já resolve o problema.

1) Deslique o recurso CHIMNEY do windows:

Netsh int ip set chimney DISABLED

Este recurso transfere para a placa de rede o processamento dos pacotes, o que libera o SO desta tarega, mas necessita suporte de hardware e dispositivos compativeis.

(Fonte: http://support.microsoft.com/kb/912222/pt-br)

2) Desligue o recurso "Offload TCP_LargeSend" e o "Offload Checksum" na placa de rede.

Estes recursos deveriam manter o tamanho do pacote e manter a conexão mesmo quando ocorre um problema, porem as vezes aparecem aquele "balãozinho" do windows avisando problemas na gravação de dados em rede.